Гинекологический отдел института является научным подразделением, в котором в настоящее время работают более 15 научных сотрудников, курирующих 4 клинических отделения.
Отдел акушерства
Акушерский отдел института является научным подразделением, в котором в настоящее время трудятся более 22 научных сотрудников, курирующих 8 клинических отделений.
Отдел неонатологии
Отдел занимается оказанием высококвалифицированной неонатальной помощи новорожденным и недоношенным детям. Основная задача: диагностика, лечение и профилактика различной патологии у новорожденных детей.
Научная лаборатория
Была создана в 1980 году. В 1983 году было слияние двух лабораторий – научной с биохимического и клиникой лабораторией , и стало по сей день наименоваться научной лабораторией биохимии, клиники и иммунологии.
Организационно-методический отдел
Организационно-методический отдел, интегрируя богатый ресурс архивного и научного потенциала, осуществляет выполнение широкого спектра научно-организационных тем.